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納米孔測序儀GridION X5即將在辰山植物園投入運行

  基因測序作為目前常用的高新技術(shù),行業(yè)熱度不斷攀升,其在醫(yī)療方面的應(yīng)用廣受矚目。

  上海辰山植物園(上海辰山植物科學(xué)研究中心)于2018年利用專項經(jīng)費購置了Oxford Nanopore公司出品的納米孔測序儀GridION X5,并于12月10日完成安裝調(diào)試和初級培訓(xùn)工作,即將投入使用。

  12月10日上午,特邀中國科學(xué)院植物逆境研究中心張蘅研究員、與實驗室工作人員、儀器安裝和培訓(xùn)工程師一同開箱清點合同約定的供貨內(nèi)容并開機測試,確認(rèn)貨物齊備、儀器完好。12月10日下午,工程師對儀器技術(shù)和基礎(chǔ)應(yīng)用、數(shù)據(jù)處理等進行了培訓(xùn),20余人參與。GridION能夠在48小時內(nèi)生成100 Gb的數(shù)據(jù),并具有全面的數(shù)據(jù)處理能力。GridION X5系統(tǒng)的測序部分包含五個流動槽。這些流動槽可單獨使用或協(xié)同使用,并通過USB連接到計算機。與所有的納米孔測序一樣,它沒有固定的運行時間。計算機可以控制五個流動槽。系統(tǒng)運行新一代的GPU以及Linux操作系統(tǒng)。此外,納米孔核酸測序儀是目前唯一一類能對核酸分子本身進行實時數(shù)據(jù)測定和分析的核酸測定儀,即無需進行PCR或DNA酶合成等過程,因而可以減小誤差,真實反映核酸分子序列的情況,且不受核酸分子長度的影響,目前單條測定能達到2.5Mb長度。

  該儀器將在服務(wù)于辰山科研中心各課題組的研究需要的同時通過上海研發(fā)公共服務(wù)平臺向社會共享服務(wù)。

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